På August 26, 1988, Aung San Suu Kyi vundet anerkendelse som en effektiv leder af oppositionen Nationale Liga for Demokrati (NLD), senere modsætning til militæret-led SLORC. Aung San Suu Kyi blev generalsekretær for den Nationale Liga for Demokrati, og var en karismatisk og effektiv højttaler til fordel for demokrati i hele landet. Hun blev anbragt i husarrest af SLORC for at forsøge at splitte hæren, en afgift, hun konsekvent benægtede.,
selvom hun ikke fik lov til at stille op til valg i Maj 27, 1990, vandt valg, hendes parti, NLD, meget til militærets forbløffelse og ubehag, 80 procent af de lovgivningsmæssige pladser. De fik aldrig lov til at tiltræde. Aung San Suu Kyi fik i de første år af hendes husarrest ikke lov til at have nogen besøgende, men senere fik hendes nærmeste familie lov til at være sammen med hende på lejlighedsvise rejser til Myanmar. I januar 1994 fik den første besøgende uden for hendes familie, den amerikanske kongresmedlem Bill Richardson, en demokrat fra Ne.me .ico, lov til at mødes med hende., Hun blev anerkendt som samvittighedsfanger af Amnesty International. De Forenede Nationer og et stort antal andre nationale og internationale grupper opfordrede til hendes ubetingede frigivelse. Hun vandt mange priser for demokrati og menneskerettigheder, herunder Sakharovprisen for tankefrihed (Europa-Parlamentet, 1991), Nobels Fredspris (1991) og den internationale Simon Bolivarpris (UNESCO, 1992).Aung San Suu Kyi var under militær overvågning og husarrest indtil juli 1995., Regeringen begrænsede løbende sin bevægelse i både landet og i udlandet. Under Suu Kyi ” s første år af frihed, hun var kun tilladt kort rejse i og omkring hendes hjemby Rangoon og ikke rejse uden for Myanmar. Hun fortsatte dog med at tjene som vokalleder for NLD og presse på for demokrati.