Reptilia (grønt felt) er en paraphyletic gruppe bestående af alle amniotes (Amniota), bortset fra to undergrupper: Mammalia (pattedyr), og Aves (birds), og derfor Reptilia er ikke en clade. I modsætning hertil er Amniota selv en clade, som er en monofyletisk gruppe.,
Cladogram af primater, der viser en monophyly (de aber, i gule), en paraphyly (de halvaber, i blå, herunder den røde patch), og en polyphyly (nat-aktive primater, lorises og tarsiers, i red).
I cladisticsEdit
Grupper, der omfatter alle efterkommere af en fælles forfader siges at være svampenes., En parafyletisk gruppe er en monofyletisk gruppe, hvorfra en eller flere subsidiære clades (monofyletiske grupper) udelukkes for at danne en separat gruppe. Videnskabsfilosof Marc Ereshefsky har hævdet, at parafyletiske ta .aer er resultatet af anagenese i den eller de udelukkede grupper. Cladists ikke give paraphyletic assemblager status af “grupper” eller reify dem med forklaringer, fordi de repræsenterer evolutionære ikke-begivenheder
En gruppe, hvis identificere funktioner udviklet sig convergently i to eller flere slægter er polyphyletic (græsk πολύς , “mange”)., Mere bredt kan ethvert ta .on, der ikke er parafyletisk eller monofyletisk, kaldes polyfyletisk. Empirisk er sondringen mellem polyfyletiske grupper og parafyletiske grupper ret vilkårlig, da karaktertilstandene for fælles forfædre er afledninger, ikke observationer.
disse udtryk blev udviklet under debatterne i 1960 ‘erne og 1970’ erne, der fulgte med stigningen i cladistik.Parafyletiske grupperinger betragtes som problematiske af mange ta .onomer, da det ikke er muligt at tale præcist om deres fylogenetiske forhold, deres karakteristiske træk og bogstavelig udryddelse., Relaterede udtryk er stamgruppe, kronospecies, spirende kladogenese, anagenese eller “grade” grupperinger. Parafyletiske grupper er ofte relikvier fra forældede hypoteser om fylogene forhold fra før stigningen af cladistik.
ExamplesEdit
Hvepse er paraphyletic, bestående af clade Apocrita uden myrer og bier, der ikke normalt anses for at være hvepse; den sawflies (“Symphyta”) også er paraphyletic, som Apocrita er indlejret i den Symphytan klader.,
prokaryoterne (enkeltcellede livsformer uden cellekerner), fordi de udelukker eukaryoterne, en efterkommer gruppe. Bakterier og arkæer er prokaryoter, men arkæer og eukaryoter deler en fælles forfader, der ikke er forfædre til bakterierne. Den prokaryote/eukaryote der blev foreslået af Edouard Chatton i 1937 og var generelt accepteret, efter at være vedtaget af Roger Stanier, og C. B. van Niel i 1962., Den botaniske kode (den ICBN, nu ICN) opgivet behandling af bakterielle nomenklatur i 1975; i øjeblikket, prokaryote nomenklatur, der er reguleret i henhold til den ICNB med startdato den 1. januar 1980 (i modsætning til en 1753 startdato under ICBN/ICN).
blandt planter er dicotyledoner (i traditionel forstand) parafyletiske, fordi gruppen udelukker monocotyledoner. “Dicotyledon” er ikke blevet brugt som en botanisk klassifikation i årtier, men er tilladt som et synonym for Magnoliopsida. Fylogenetisk analyse indikerer, at monocoterne er en udvikling fra en dicot-forfader., Bortset fra monokoter fra dicoterne gør sidstnævnte til en paraphyletisk gruppe.
blandt dyr er flere kendte grupper faktisk ikke clades. Ordenen Artiodactyla (jævnt hovdyr) som traditionelt defineret er parafyletisk, fordi den udelukker hvaler (hvaler, delfiner osv.). Under rækken af IC .n-koden er de to ta .aer separate ordrer. Molekylære undersøgelser har imidlertid vist, at Cetacea nedstammer fra artiodactyl forfædre, selvom den præcise fylogeni inden for ordren forbliver usikker. Uden hvaler er Artiodactylerne parafyletiske.,Klassen Reptilia, som traditionelt defineret, er parafyletisk, fordi den udelukker fugle (klasse Aves) og pattedyr. Under rækken af IC .n-koden er disse tre ta .a separate klasser. Imidlertid kommer pattedyr fra synapsiderne (som engang blev beskrevet som “pattedyrlignende krybdyr”), og fugle er søstertaonon til en gruppe dinosaurer (en del af Diapsida), som begge er “krybdyr”. Alternativt er krybdyr parafyletiske, fordi de gav anledning til (kun) fugle. Fugle og krybdyr sammen gør Sauropsids, en clade af Amniota, der er søstergruppen af clade, der omfatter pattedyr.,
Osteichthyes, knoklet fisk, er paraphyletic når afgrænset til kun at omfatte Actinopterygii (ray fisk) og Sarcopterygii (lungefisk, osv.), og for at udelukke tetrapoder; for nylig behandles Osteichthyes som en clade, herunder tetrapods.
“hvepsene” er parafyletiske, der består af den smalle talje Apocrita uden myrer og bier. Sa .flies (Symphyta) er ligeledes paraphyletic, danner alle Hymenoptera bortset fra Apocrita, en clade dybt inde i Sa .fly træet.Krebsdyr er ikke en clade, fordi he .apoda (insekter) er udelukket., Den moderne clade, der spænder over dem alle, er Tetraconata.
et af målene med moderne taksonomi i de sidste halvtreds år har været at eliminere parafyletiske “grupper” som eksemplerne her fra formelle klassifikationer.
Paraphyly i speciesEdit
Arter har en særlig status i systematik som værende en observerbare træk ved naturen selv, og som den grundlæggende enhed i klassificeringen., Nogle artikuleringer af det fylogenetiske artskoncept kræver, at arter er monofyletiske, men parafyletiske arter er almindelige i naturen, i det omfang de ikke har en enkelt fælles forfader. Ja, for seksuelt reproducerende ta .a, ingen arter har en “enkelt fælles forfader” organisme. Parafyly er almindelig i artsdannelse, hvorved en moderart (en paraspecies) giver anledning til en datterart uden selv at uddø. Forskning viser så mange som 20 procent af alle dyrearter og mellem 20 og 50 procent af plantearter er parafyletiske., Regnskab for disse fakta, Nogle ta .onomer hævder, at parafyly er et naturtræk, der bør anerkendes på højere taksonomiske niveauer.
Cladists fortaler for en fylogenetisk arter koncept, der ikke mener, at arter, som udviser egenskaber monophyly eller paraphyly, begreber under det perspektiv, som kun gælder for grupper af arter., De mener, Zander”er en forlængelse af den “paraphyletic arter” argument til højere taksonomiske grupper til at repræsentere en kategori fejl
Bruger for paraphyletic groupsEdit
Når forekomsten af væsentlige træk har ført en subclade på en evolutionær vej meget forskellig fra en mere inkluderende clade, det ofte giver mening at studere den paraphyletic gruppe, der forbliver uden hensyntagen til de større clade., For eksempel, den Neogene udviklingen af Artiodactyla (parrettåede hovdyr, som rådyr, køer, grise og flodheste – bemærk, at Cervidae, Bovidae, Svin og Hippopotamidae, at de familier, der indeholder disse forskellige artiodactyls, er alle svampenes grupper), der har fundet sted i miljøer, så forskellig fra det, der af ordenen cetacea (hvaler, delfiner og marsvin), at Artiodactyla er ofte studeret i isolation, selv om de hvaler er en efterkommer-gruppen., Prokaryote-gruppen er et andet eksempel; det er parafyletisk, fordi det er sammensat af to domæner (Eubacteria og Archaea) og udelukker (eukaryoterne). Det er meget nyttigt, fordi det har en klart defineret og betydelig sondring (fravær af en cellekerne, en plesiomorfi) fra sine udelukkede efterkommere.
nogle systematister genkender også parafyletiske grupper som involveret i evolutionære overgange, udviklingen af de første tetrapoder fra deres forfædre for eksempel., Ethvert navn, der gives til disse hypotetiske forfædre for at skelne dem fra tetrapoder—for eksempel”fisk”—vælger nødvendigvis en paraphyletisk gruppe, fordi de efterkommer tetrapoder ikke er inkluderet. Andre systematister overveje reification af parafyletiske grupper til obskure udledte mønstre af evolutionær historie.
udtrykket “evolutionær karakter” bruges undertiden til parafyletiske grupper.Desuden er begreberne monofyl, paraphyly og polyfyly blevet anvendt til at udlede nøglegener til stregkodning af forskellige grupper af arter.,
Selvstændigt udviklet sig traitsEdit
Nuværende fylogenetiske hypoteser for tetrapod relationer indebærer, at viviparity, produktion af afkom uden ekstern udlægning af et befrugtet æg, der er udviklet uafhængigt i de slægter, der førte til mennesker (Homo sapiens) og det sydlige vand skinker (Eulampus tympanon, en slags firben). Sagt på en anden måde, viviparity er en synapomorphy for Theria inden for pattedyr, og en autapomorphy for Eulamprus tympanon (eller måske en synapomorphy, hvis andre Eulamprus arter er også viviparous).,
“grupper” baseret på uafhængigt udviklede træk som disse eksempler på viviparity repræsenterer eksempler på polyfyly, ikke parafyly.
Not paraphylyEdit
- amfibiske fisk er polyfyletiske, ikke parafyletiske. Selvom de ser ens ud, flere forskellige grupper af amfibiske fisk, såsom mudskippere og lungfisk, udviklede sig uafhængigt i en proces med konvergent udvikling i fjerne slægtninge, der står over for lignende økologiske forhold.,
- Flyveløse fugle er polyfyletiske, fordi de uafhængigt (parallelt) mistede evnen til at flyve.
- Dyr med en rygfinne er ikke paraphyletic, selvom deres sidste fælles forfader måtte have haft sådan en fin, fordi den Mesozoiske forfædre af marsvin ikke har sådan en fin, der henviser til, at pre-Mesozoiske fisk havde en.
- Quaduadrupedal archosaurs er ikke en parafyletisk gruppe. Bipedale dinosaurer som Eoraptor, forfædre til quaduadrupedal dem, var efterkommere af den sidste fælles forfader til quaduadrupedal dinosaurer og andre quaduadrupedal archosaurs som krokodillerne.,
ikke-udtømmende liste over paraphyletiske grupperRediger
følgende liste rekapitulerer en række paraphyletiske grupper foreslået i litteraturen og indeholder de tilsvarende monofyletiske ta .aer.,ia