Nomenclature et taxonomie
e. rhusiopathiae, littéralement « fil de l’érysipèle de la maladie rouge », a une longue histoire avec de nombreux changements de nomenclature. Le premier membre du genre Érysipélothrix a été appelé E. muriseptica, isolé pour la première fois par Koch en 1876 à partir du sang de souris atteintes de septicémie. Par la suite, Erysipelothrix a été identifié comme la cause de l’infection chez de nombreuses espèces animales et trois espèces distinctes de l’organisme, E. muriseptica, E. porci et E., érysipéloïde, ont été proposés sur la base de leur isolement des souris, des porcs et des humains, respectivement. Il a été réalisé plus tard que ces trois organismes étaient des souches presque identiques de la même espèce. Le nom E. insidiosa leur a été proposé à l’origine par Trevisan en 1885. Ce nom et les 36 autres noms documentés pour l’organisme ont été rejetés en 1966 en faveur d’E. rhusiopathiae, une combinaison née en 1918 .
Érysipélothrix a démontré une grande variation sérologique, biochimique et antigénique entre les souches., Les tests de pathogénicité ont montré qu’un groupe de souches avirulentes du sérotype 7 provenait principalement d’amygdales de porc . Ils se sont ensuite révélés génétiquement distincts de E. rhusiopathiae par des études de composition de base D’ADN et D’homologie ADN–ADN . Ces souches ont formé la base d’une nouvelle espèce, E. tonsillarum, et appartenaient à des sérotypes 3, 7, 10, 14, 20, 22 et 23. Quelques autres souches représentant le sérotype 13 (Erysipelothrix sp. souche 1) et 18 (Érysipélothrix sp. la souche 2) a présenté de faibles niveaux D’hybridation avec les souches de type E. rhusiopathiae et E., tonsillarum, indiquant que ces sérotypes peuvent être membres d’une nouvelle espèce génomique . À l’origine, E. tonsillarum était considéré comme morphologiquement et biochimiquement identique à E. rhusiopathiae, mais il a été démontré plus tard que E. tonsillarum pouvait fermenter le saccharose, alors que E. rhusiopathiae ne le pouvait pas . De plus, la majorité des souches D’E. tonsillarum (96%) étaient avirulentes tandis que 66% des souches D’E. rhusiopathiae produisaient des maladies chez les porcs . D’autre part, une étude a révélé que E. tonsillarum a été isolé à partir de sites systémiques de 3,4% des carcasses qui étaient négatives pour E., rhusiopathiae, indiquant l’importance potentielle de cet organisme dans la pathogenèse de l’érysipèle porcin . La comparaison de la composition des protéines à l’aide d’une méthode d’évaluation informatisée a révélé que la moyenne géométrique des similitudes était de 0,980±0,018 entre les souches D’E. rhusiopathiae, de 0,979±0,013 pour les souches D’E. tonsillarum et de 0,932±0,036 entre les souches d’autres espèces D’Érysipélothrix. Cependant, l’étude n’a pas établi de valeur seuil applicable pour l’identification d’une souche donnée au niveau de l’espèce . Analyse phylogénétique des gènes de l’ARNr 16S d’E. rhusiopathiae et D’E., tonsillarum a montré que les deux séquences sont presque identiques (99,8%) avec seulement trois différences de nucléotides . Bien qu’il ait été suggéré que les séquences d’ARNr 16S puissent être utilisées régulièrement pour distinguer et établir des relations entre les genres et les espèces bien résolues, des espèces très récemment divergées comme E. rhusiopathiae et E. tonsillarum peuvent ne pas être distinguables .
E. rhusiopathiae est plus susceptible d’être confondue avec d’autres bactéries Gram-positives, non sporantes, en forme de bâtonnets, telles que les membres des genres Brochothrix, Corynebacterium, Lactobacillus, Listeria et Kurthia., Il était autrefois considéré comme un proche parent du genre Listeria , mais les études sur le peptidoglycane de la paroi cellulaire , les patrons d’acides gras , l’hybridation de l’ADN et les études taxonomiques numériques ne corroboraient pas cette relation. Érysipélothrix peut être distingué de Listeria dans la composition de la paroi cellulaire, car Érysipélothrix contient de la lysine et de la glycine tandis que Listeria contient de l’acide mésodiaminopimélique . Aucun antigène commun entre les souches D’Érysipélothrix et de Listeria monocytogenes n’a été détecté par immunodiffusion ou par hémagglutination passive . Brochothrix et Corynebacterium ont également été distingués de E., rhusiopathiae sur la base de contenir de l’acide mésodiaminopimélique dans la paroi cellulaire. Le test de catalase permet de distinguer E. rhusiopathiae des espèces de Kurthia catalase-positives. Une relation plus étroite entre Erysipelothrix et la famille des Lactobacillaceae qu’avec les Corynebacteriaceae a été mise en évidence à l’aide d’études de ratios enzymatiques et basés sur L’ADN . Dans une étude de plus de 200 souches de bactéries coryneformes utilisant des tests morphologiques, physiologiques et biochimiques et une analyse informatique, Érysipélothrix était le plus étroitement lié à Streptococcus pyogenes ., D’autres études taxonomiques moléculaires ont conclu que le genre Érysipélothrix est un groupe distinct d’organismes, le plus semblable aux streptocoques .
les résultats de l’analyse de l’ARNr 16S indiquent que E. rhusiopathiae a une relation plus étroite avec Clostridium innocuum . Les deux organismes contiennent de la lysine dans leur paroi cellulaire. C. innocuum est un membre du groupe D’ARN qui contient les mycoplasmes et qui fait lui-même partie du groupe clostridien beaucoup plus large ., L’analyse phylogénétique basée sur des séquences Hsp70 dans la région du gène dnaK (Hsp70) de Mycoplasma capricolum a montré que les espèces de Mycoplasma ramifiées avec le groupe Gram positif à faible teneur en G+C de bactéries, y compris les espèces Lactobacillus et Érysipélothrix, dans 87% et 96% des répliques bootstrap, respectivement, indiquant la relation évolutive étroite D’Érysipélothrix avec ce groupe .
la plus récente analyse complète de la séquence du génome révèle que les caractéristiques générales du génome d’E. rhusiopathiae sont similaires à celles d’autres bactéries à Gram positif., Cependant, il manque de nombreux gènes orthologues pour la biosynthèse des acides teichoïques de paroi (WTA) et des acides lipoteichoïques (LTA) et de l’opéron dltABCD. Il a une perte complète des voies de biosynthèse d’acide gras et manque des gènes pour la biosynthèse de beaucoup d’acides aminés, de cofacteurs et de vitamines. Ceux-ci indiquent une évolution réductrice du génome. Le génome d’E. rhusiopathiae représente les traits évolutifs des Firmicutes et des Mollicutes et fournit de nouvelles informations sur ses adaptations évolutives pour la survie intracellulaire .