El príncipe más iluminado de la familia Lorena que gobernó la Toscana durante más de un siglo, el Gran Duque Pietro Leopoldo, unió en 1784 todas las escuelas de dibujo Florentinas en una «academia». También fundó una galería para exponer pinturas con el objetivo de facilitar el estudio de los alumnos de la Academia. La sede elegida es la ubicación actual del museo, un edificio que originalmente albergaba el «Hospital de San Mateo», ampliado en el tiempo a través de la adición de varios espacios adyacentes.,
la consistencia y composición de la colección expuesta en este museo ha cambiado con el tiempo debido a la adición de obras de arte retiradas de conventos suprimidos, pero también debido a la pérdida de obras entregadas temporalmente o devueltas a otros museos florentinos, en particular a los Uffizi (Bottlicelli»S «Primavera» se exhibió aquí durante muchos años)., Con el tiempo, la galería se ha convertido en uno de los principales museos de la ciudad, también gracias a la adquisición de algunas obras maestras extraordinarias, como La «Piedad» de Giovanni da Milano (siglo XIV); la «Anunciación» de Lorenzo Monaco (siglo XV); el espléndido frontal llamado «Cassone Adimari»que muestra una suntuosa procesión matrimonial (c. 1450) y la «Virgen Del Mar»atribuida a Botticelli (1445-1510).
en 1873, cuando el David de Miguel Ángel fue exhibido por primera vez en una tribuna especialmente arreglada., Con fines de protección, la estatua fue de hecho retirada de Piazza Signoria, donde había representado durante más de cuatro siglos la fuerza y la dignidad de la República Florentina. En los primeros años del siglo XX, a esta estatua se unieron otras obras de arte extraordinarias del mismo artista, como «San Mateo»y los cuatro «prisioneros» originalmente hechos para la tumba del Papa Julio II en Roma, pero colocados en la gruta de los jardines de Boboli a finales del siglo XV, y finalmente por la «Pietà di Palestrina» (cuya atribución al maestro es todavía de alguna manera controvertida).,
una organización capilar y la restauración de algunas de las habitaciones de la planta superior han permitido al Museo integrar recientemente la colección con una serie de pinturas de los siglos XIV al XVI y abrir una sala que muestra los modelos de tiza de famosos escultores del siglo XIX como Lorenzo Bartolini y Luigi Pampaloni.,
El 26 de abril de 1527, después de la expulsión de los Medici de Florencia, desató una verdadera guerrilla urbana centrada precisamente en la cabeza de David, con republicanos atrincherados en Palazzo Vecchio donde trataban de despedir a los partidarios de los Medici que empujaban a la puerta. Desde las ventanas del edificio volaron piedras y azulejos y un banco golpeó el brazo izquierdo de David, rompiéndolo en tres pedazos, recuperados por los jóvenes Vasari y Salviati después de haber sido abandonados en la Tierra durante tres días.,
probablemente en esta ocasión debe haber producido la división de la honda, claramente visible detrás de su espalda, la pérdida de algunas puntas de rizos y una pequeña ruptura a lo largo del párpado inferior del ojo derecho.en 1991 el pie de la estatua fue dañado por un hombre trastornado con un martillo, destruyendo un dedo del pie izquierdo, reconstruido rápidamente.