Reptilia (vihreä kenttä) on paraphyletic ryhmä, johon kuuluvat kaikki amniotes (Amniota) lukuun ottamatta kahteen alaryhmään: Mammalia (nisäkkäät) ja Aves (linnut); siksi, Reptilia ei ole haaran. Sen sijaan Amnioota itsessään on kladi, joka on monofyleettinen ryhmä.,
Cladogram kädellisten, osoittaa monophyly (the simians, keltainen), on paraphyly (the puoliapinat, sininen, mukaan lukien red patch), ja polyphyly (yö-aktiivinen kädellisten luokka, lorises ja tarsiers, punainen).
Vuonna cladisticsEdit
Ryhmät, jotka sisältävät kaikki jälkeläiset yhteinen esi-isä sanotaan olevan monophyletic., A paraphyletic ryhmä on monophyletic ryhmä, josta yksi tai useampi tytäryhtiö clades (monophyletic ryhmät) eivät kuulu muodostavat erillisen ryhmän. Tieteenfilosofi Marc Ereshefsky on väittänyt, että parafyleettinen taxa on seurausta anageneesista syrjäytyneessä ryhmässä tai ryhmissä. Cladists eivät myönnä paraphyletic kokoonpanokohtien tila ”ryhmät” tai reify niitä selityksiä, koska ne edustavat evoluution ei-tapahtumat
ryhmään, jonka tunnistaminen-ominaisuudet kehittynyt convergently kahden tai useamman suvusta on polyphyletic (kreikan πολύς , ”monta”)., Laajemmin mitä tahansa taksonia, joka ei ole parafyleettinen tai monofyleettinen, voidaan kutsua polyfyleettiseksi. Empiirisesti ero polyphyletic ryhmien ja paraphyletic ryhmät on melko mielivaltainen, koska merkki valtiot yhteiset esi-isät ovat päätelmiä, ei huomautuksia.
Nämä ehdot kehitettiin keskustelujen aikana 1960-ja 1970-luvuilla mukana nousu cladistics.
Paraphyletic ryhmittymien pidetään ongelmallisena monet taksonomit, koska se ei ole mahdollista puhua juuri heidän fylogeneettiseen suhteet, niiden tunnusomaisia piirteitä ja kirjaimellinen sukupuuttoon., Liittyvät termit ovat stem ryhmä, kronospecies, orastava kladogeneesi, anagenesis, tai ”grade” ryhmittelyt. Parafyleettiset ryhmät ovat usein jäänteitä vanhentuneista fylogeenisten suhteiden hypoteeseista ennen kladistiikan nousua.
ExamplesEdit
Ampiaiset ovat paraphyletic, joka koostuu haaran Apocrita ilman muurahaisia ja mehiläisiä, jotka eivät yleensä pidetään ampiaiset; sahapistiäisten (”Symphyta”) ovat liian paraphyletic, kuten Apocrita ovat sisäkkäin Symphytan clades.,
prokaryootit (yksisoluisia elämänmuotoja ilman solujen tumia), koska ne sulje pois eukaryooteissa, jälkeläinen ryhmä. Bakteerit ja Arkkieliöt ovat prokaryootteja, mutta arkkien ja eukaryooteissa on yhteinen esi-isä, joka ei ole esi-bakteerit. Se prokaryote/eukaryote ero oli ehdottanut Edouard Chatton vuonna 1937 ja oli yleisesti hyväksytty, sen jälkeen kun se on hyväksytty Roger Stanier ja C. B. van Niel vuonna 1962., Kasvitieteellinen koodi (ICBN, nyt ICN) hylätty huomioon bakteeri-nimikkeistön vuonna 1975; tällä hetkellä, prokaryootti-nimikkeistön säännellään ICNB kanssa alkaa 1 päivänä tammikuuta 1980 (toisin kuin 1753 aloituspäivä alle ICBN/ICN).
Joukossa kasvit, dicotyledons (perinteisessä mielessä) ovat paraphyletic, koska ryhmän sisällä monocotyledons. ”Dicotyledon” ei ole käytetty kasvitieteellinen luokitus vuosikymmeniä, mutta on sallittua synonyyminä Magnoliopsida. Fylogeneettinen analyysi osoittaa, että yksisirkkaiset ovat kehityksen kaksisirkkainen esi-isä., Ilman yksisirkkaisten päässä kaksisirkkaisten tekee jälkimmäinen paraphyletic ryhmä.
eläinten Keskuudessa, useat tutut ryhmät eivät ole, itse asiassa, clades. Perinteisesti määritelty Artiodactyla-lahko (para-toed sorkka-ja kavioeläimet) on parafyleettinen, koska siihen eivät kuulu valaat (valaat, delfiinit jne.). ICZN-koodin riveissä kaksi taksaa ovat erillisiä tilauksia. Molekyyli tutkimukset kuitenkin ovat osoittaneet, että Cetacea laskeutua artiodactyl esi-isänsä, vaikka tarkka phylogeny tilauksen sisällä on edelleen epävarma. Ilman valaita Artiodactylit ovat parafyleettisiä.,Perinteisesti määritelty Reptilia-luokka on parafyleettinen, koska siihen eivät kuulu linnut (Luokka Aves) eikä Nisäkkäät. ICZN-koodin riveissä nämä kolme taksaa ovat erillisiä luokkia. Kuitenkin, nisäkkäät kotoisin synapsids (joita joskus kuvataan ”nisäkäs-kuten matelijat”) ja linnut ovat sisko taksoni ryhmä dinosaurukset (osa Diapsida), jotka molemmat ovat ”matelijat”. Vaihtoehtoisesti matelijat ovat parafyleettisiä, koska ne synnyttivät (vain) lintuja. Linnut ja matelijat yhdessä tekevät Sauropsideista Lapsivesipiston kladin, joka on kladin sisarryhmä, johon kuuluvat Nisäkkäät.,
Osteichthyes, luinen kalaa, ovat paraphyletic kun rajattu koskemaan vain Actinopterygii (ray-finned kala) ja Sarcopterygii (keuhko kala, jne.), ja jättää tetrapods, enemmän äskettäin, Osteichthyes käsitellään haaran, mukaan lukien tetrapods.
”ampiaiset” ovat parafyleettisiä, jotka koostuvat kapeavyötäröisistä Apokritioista ilman muurahaisia ja mehiläisiä. Se sahapistiäisten (Symphyta) ovat vastaavasti paraphyletic, muodostaen kaikki Hymenoptera lukuun ottamatta Apocrita, a-haaran syvällä lehtipistiäinen puu.Äyriäiset eivät ole kladi, koska Heksapodat (hyönteiset) on suljettu pois., Moderni kladi, joka sylkee ne kaikki, on Tetrakonata.
Yksi tavoitteista modernin taksonomian viimeisten viidenkymmenen vuoden aikana on ollut poistaa paraphyletic ”ryhmät”, kuten esimerkeissä virallisista luokituksista.
Paraphyly vuonna speciesEdit
Laji on erityinen asema systematiikka on havaittavissa piirre luonto itse ja perusyksikkö luokitus., Jotkut nivelet ja fylogeneettiseen lajien käsite edellyttää lajien olevan monophyletic, mutta paraphyletic lajit ovat yleisiä luonnossa, siinä määrin, että he eivät ole yksi yhteinen esi-isä. Todellakin, seksuaalisesti lisääntyvät taksonien, ei laji on ”yksi yhteinen esi-isä” organismi. Paraphyly on yleinen lajiutuminen, jossa äiti lajeja (a paraspecies) synnyttää tyttären lajeja ilman itsensä sukupuuttoon. Tutkimusten mukaan jopa 20 prosenttia kaikista eläinlajeista ja 20-50 prosenttia kasvilajeista on parafyleettisiä., Jotkut taksonomistit väittävät näiden tosiasioiden perusteella, että parafyly on luonteenpiirre, joka tulisi tunnustaa korkeammalla taksonomisella tasolla.
Cladists puolestapuhuja fylogeneettiseen lajien käsite, joka ei katso lajia näytteille ominaisuuksia monophyly tai paraphyly, konseptien näkökulmasta, jotka koskevat vain ryhmien lajeja., He pitävät Kuha”s laajentaminen ”paraphyletic laji” argumentti korkeamman eliösystematiikan edustaa luokan virhe
Käyttää paraphyletic groupsEdit
Kun ulkonäkö merkittäviä piirteitä on johtanut subclade evoluution polku on hyvin erilaiset siitä enemmän osallistavaa haaran, se usein järkevää tutkia paraphyletic ryhmä, joka jää ottamatta huomioon suuremman haaran., Esimerkiksi Neogene kehitys Artiodactyla (edes-toed sorkka-ja kavioeläimet, kuten peuroja, lehmiä, sikoja ja virtahevot – huomaa, että Hirven -, Bovidae, Suidae-ja Virtahevot, perheet, jotka sisältävät nämä eri artiodactyls, ovat kaikki monophyletic ryhmät) on tapahtunut ympäristöissä niin erilainen, että Cetacea (valaat, delfiinit ja pyöriäiset), että Artiodactyla on usein tutkittu erikseen, vaikka valaat ovat jälkeläinen ryhmä., Se prokaryote ryhmä on toinen esimerkki; se on paraphyletic, koska se koostuu kaksi Verkkotunnuksia (Näytteessä ja Arkkien) ja sulkee pois (the integration). Se on erittäin hyödyllinen, koska se on selkeästi määritelty ja merkittävä ero (ilman solun tumassa, plesiomorphy) sen ulkopuolelle jälkeläisiä.
Myös jotkut systematists tunnistaa paraphyletic ryhmissä on mukana evoluution siirtymät, kehitys ensimmäisen tetrapods niiden esi-isät esimerkiksi., Kaikki annettu nimi nämä hypoteettinen esi erottaa ne tetrapods—”kala”, esimerkiksi—välttämättä valitsee paraphyletic ryhmä, koska jälkeläinen tetrapods eivät ole mukana. Muut systematists harkita esineellistämiselle paraphyletic ryhmät, hämärtää päätellä malleja evoluution historiassa.
parafyleettisistä ryhmistä käytetään joskus termiä ”evolutionaarinen grade”.Lisäksi käsitteitä monofylinen, parafyleettinen ja polyfylinen on käytetty pääteltäessä keskeisiä geenejä erilaisten lajiryhmien haukkumiseen.,
Itsenäisesti kehittynyt traitsEdit
Nykyinen fylogeneettiseen hypoteeseja tetrapod suhteita tarkoita sitä, että viviparity, tuotanto jälkeläisiä ilman ulkoista jossa hedelmöittynyt munasolu, kehittynyt itsenäisesti suvusta, joka johti ihmisten (Homo sapiens) ja etelä-vesi skinkit (Eulampus päätykolmiossa, eräänlainen lisko). Laita toinen tapa, viviparity on synapomorphy varten Theria kuluessa nisäkkäät, ja autapomorphy varten Eulamprus päätykolmiossa (tai ehkä synapomorphy, jos muut Eulamprus lajit ovat myös viviparous).,
itsenäisesti kehitettyihin piirteisiin perustuvat”ryhmät”, kuten nämä vivipariteetin esimerkit, edustavat esimerkkejä polyfyliasta, eivät parafylysta.
Ei paraphylyEdit
- Kahtalaisesta kalat ovat polyphyletic, ei paraphyletic. Vaikka ne näyttävät samanlaisilta, useita eri ryhmiä kahtalaisesta kaloja, kuten mudskippers ja lungfishes kehittynyt itsenäisesti prosessi convergent evolution kaukaisten sukulaisten edessä on samanlaiset ekologiset olosuhteet.,
- lentokyvyttömät linnut ovat polyfyleettisiä, koska ne itsenäisesti (rinnakkain) menettivät lentokyvyn.
- Eläinten kanssa selkäevä ei paraphyletic, vaikka heidän viimeinen yhteinen esi-isä on saattanut olla tällainen fin, koska Mesozoic esi pyöriäisiä ei ollut niin lopullinen, kun taas pre-Mesozoic kala ei ole yksi.
- Quadrupedal archosaurit eivät ole parafyleettinen ryhmä. Bipedal dinosaurukset kuten Eoraptor, esi quadrupedal ne olivat jälkeläisiä viimeinen yhteinen esi-isä quadrupedal dinosaurukset ja muut quadrupedal archosaurs, kuten crocodilians.,
Ei-tyhjentävä luettelo paraphyletic groupsEdit
seuraavassa luettelossa esitetään useita paraphyletic ryhmien ehdotettu kirjallisuudessa, ja tarjoaa vastaavan monophyletic taksonien.,ia