Ruusu

Nimistö ja Taksonomia

E. rhusiopathiae, kirjaimellisesti ’ruusu punainen lanka sairaus’, on pitkä historia monien nimikkeistön muutokset. Varhaisin sukuun Erysipelothrix kutsuttiin E. muriseptica, ensin eristetty Koch vuonna 1876 verestä hiiret verenmyrkytyksen. Myöhemmin, Erysipelothrix on tunnistettu syy infektio monilla eläinlajeilla ja kolme erillistä lajin organismin, E. muriseptica, E. porci ja E., erysipeloidia ehdotettiin, koska se eristettiin hiiristä, sioista ja ihmisistä. Myöhemmin huomattiin, että nämä kolme eliötä olivat lähes identtisiä saman lajin kantoja. Nimen E. insidiosa heille ehdotti alun perin Trevisan vuonna 1885. Tämä ja kaikki 36 muuta organismin dokumentoitua nimeä hylättiin vuonna 1966 E. rhusiopathiae-yhdistelmän hyväksi, joka sai alkunsa vuonna 1918 .

Erysipelothrix osoitti suurta serologista, biokemiallista ja antigeenistä vaihtelua kantojen välillä., Patogeenisyystestit osoittivat, että serotyypin 7 avirulenttien kantojen klusteri on peräisin pääasiassa sian nielurisoista . He olivat myöhemmin todettu olevan geneettisesti erillään E. rhusiopathiae DNA-emäs koostumus ja DNA–DNA-homologia tutkimukset . Nämä kannat muodostivat perustan uuden lajin, E. tonsillarum, ja kuului serotyyppien 3, 7, 10, 14, 20, 22 ja 23. Jotkut muut serotyyppiä 13 edustavat kannat (Erysipelothrix sp. kanta 1) ja 18 (Erysipelothrix sp. kanta 2) esiintyi alhaista hybridisaatiota sekä E. rhusiopathiae-että E-tyyppisten kantojen kanssa., tonillarum, mikä viittaa siihen, että nämä serotyypit saattavat olla uuden genomilajin jäseniä . Alun perin, E. tonsillarum pidettiin morfologisesti ja biokemiallisesti samanlaisia E. rhusiopathiae, mutta se näytettiin myöhemmin, että E. tonsillarum voisi käydä sakkaroosia, kun taas E. rhusiopathiae ei . Lisäksi suurin osa E. tonsillarum kantoja (96%) olivat tautia aiheuttamattomat kun taas 66% E. rhusiopathiae kantoja tuotettu taudin sika . Toisaalta tutkimuksessa havaittiin, että E. tonsillarum eristettiin systeemisistä kohdista 3,4 prosentista E: n osalta negatiivisista ruhoista., rhusiopathiae, mikä osoittaa tämän organismin mahdollisen merkityksen sikojen erysipelaksen patogeneesissä . Vertailu proteiinin koostumus käyttämällä atk-arviointi-menetelmä paljasti, että geometrinen keskiarvo yhtäläisyyksiä oli 0.980±0.018 välillä E. rhusiopathiae kantoja, 0.979±0.013 E. tonsillarum kantoja ja 0.932±on 0,036 välillä kantoja muita Erysipelothrix lajeja. Kuitenkin, tutkimus ei ole osoittanut raja-arvo soveltuu tunnistaminen tietyn kannan lajien tasolla . Fylogeneettinen analyysi 16s rRNA-geeneistä E. rhusiopathiae ja E., tonsillarum osoitti, että molemmat sekvenssit ovat lähes identtiset (99.8%) vain kolmen nukleotidin eroja . Vaikka se on ehdotettu, että 16S rRNA sekvenssit voidaan käyttää rutiininomaisesti erottaa ja luoda suhteita sukuihin ja hyvin ratkaistu laji, hyvin viime aikoina eriytyneet lajit, kuten E. rhusiopathiae ja E. tonsillarum voi olla erotettavissa .

E. rhusiopathiae on todennäköisesti sekoittaa muiden Gram-positiivisia, ei-pian tuottaa, sauvan muotoinen bakteeri, kuten jäsenten sukujen Brochothrix, Corynebacterium -, Lactobacillus -, Listeria-ja Kurthia., Se oli kerran katsotaan läheinen sukulainen Listeria-sukuun, mutta tutkimukset soluseinän peptidoglykaanin , rasvahappojen kuvioita , DNA-hybridisaatio , ja numeerinen taksonomiset tutkimukset eivät tue tätä suhdetta. Erysipelothrix voidaan erottaa Listeriaa soluseinän koostumus, sekä Erysipelothrix sisältää lysiinin ja glysiinin vaikka Listeria sisältää mesodiaminopimelic happoa . Immunodiffuusiolla tai passiivisilla hemagglutinaatiotesteillä ei havaittu yleisiä antigeenejä Erysipelothrix-ja Listeria monocytogenes-kantojen välillä . Myös Brochothrix ja Corynebacterium erotettiin E: stä., rhusiopathiae sen perusteella, että se sisältää mesodiaminopimeliinihappoa soluseinässä. Katalaasitestissä E. rhusiopathiae voidaan erottaa katalaasi-positiivisista Kurthia-lajeista. Läheisempi suhde Erysipelothrix perheen Lactobacillaceae kuin Corynebacteriaceae paljastui käyttäen entsyymi-ja DNA-pohjainen suhde tutkimuksissa . Tutkimuksessa, enemmän kuin 200 kantoja coryneform bakteerit käyttävät morfologiset, fysiologiset ja biokemialliset testit ja tietokone analyysi, Erysipelothrix oli eniten läheisesti Streptococcus pyogenes ., Edelleen molekyyli-taksonomiset tutkimukset ovat osoittaneet, että suvun Erysipelothrix on erillinen klusterin organismeja, eniten samanlainen streptokokit .

tulokset 16S rRNA-analyysi osoitti, että E. rhusiopathiae on läheisempi suhde Clostridium innocuum . Molemmat eliöt sisältävät lysiiniä soluseinässään. C. innocuum on jäsenenä RNA-klusteri, joka sisältää mykoplasmat ja joka itse on osa paljon laajempaa clostridial ryhmä ., Fylogeneettinen analyysi perustuu Hsp70 sekvenssit dnaK (hsp70) – geenin alueella Mycoplasma capricolum osoitti, että Mycoplasma-lajien haarautunut alhainen G+C-pitoisuus Gram-positiivisia ryhmän bakteerien kuten Lactobacillus ja Erysipelothrix lajien 87% ja 96% bootstrap rinnakkaisnäytettä, vastaavasti, mikä osoittaa, lähellä evoluution suhde Erysipelothrix tähän ryhmään .

viime täydellinen genomin analyysi paljastaa, että yleiset ominaisuudet E. rhusiopathiae genomin ovat samankaltaisia kuin muut Gram-positiiviset bakteerit., Siitä puuttuu kuitenkin monia ortologisia geenejä seinäteikhappojen (WTA) ja lipoteikhappojen (LTA) biosynteesiin sekä dltabcd-operoniin. Se menettää täysin rasvahappojen biosynteesireittejä, eikä sillä ole geenejä monien aminohappojen, kofaktorien ja vitamiinien biosynteesiin. Nämä viittaavat reduktiiviseen genomin evoluutioon. E. rhusiopathiae genomin edustaa evoluution piirteitä sekä Firmicutes ja Mollicutes ja tarjoaa uusia oivalluksia sen evoluution muutoksia solunsisäinen selviytyminen .

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista. Pakolliset kentät on merkitty *