Reptilia (champ vert) est un groupe paraphylétique comprenant tous les amniotes (amniotes) à l’exception de deux sous-groupes: Mammalia (mammifères) et Aves (oiseaux); par conséquent, Reptilia n’est pas un clade. En revanche, Amniota lui-même est un clade, qui est un groupe monophylétique.,
cladogramme des primates, montrant une monophylie (les simiens, en jaune), une paraphylie (les prosimiens, en bleu, y compris la tache rouge), et une polyphylie (les primates actifs la nuit, les loris et les tarsiers, en rouge).
En cladisticsEdit
les Groupes qui incluent tous les descendants d’un ancêtre commun que l’on dit être monophylétique., Un groupe paraphylétique est un groupe monophylétique dont un ou plusieurs clades subsidiaires (groupes monophylétiques) sont exclus pour former un groupe distinct. Le philosophe des sciences Marc Ereshefsky a soutenu que les taxons paraphylétiques sont le résultat d’une anagenèse dans le ou les groupes exclus. Les cladistes n’accordent pas aux assemblages paraphylétiques le statut de « groupes » ou ne les réifient pas avec des explications, car ils représentent des non-événements évolutifs
un groupe dont les caractéristiques d’identification ont évolué convergemment dans deux lignées ou plus est polyphylétique (Grec πολύς , « beaucoup »)., Plus largement, tout taxon qui n’est pas paraphylétique ou monophylétique peut être appelé polyphylétique. Empiriquement, la distinction entre les groupes polyphylétiques et les groupes paraphylétiques est plutôt arbitraire, car les états de caractère des ancêtres communs sont des inférences, pas des observations.
ces termes ont été développés lors des débats des années 1960 et 1970 accompagnant l’essor de la cladistique.
les groupements paraphylétiques sont considérés comme problématiques par de nombreux taxonomistes, car il n’est pas possible de parler précisément de leurs relations phylogénétiques, de leurs traits caractéristiques et de leur extinction littérale., Les termes connexes sont groupe de tige, chronospécifique, cladogenèse bourgeonnante, anagenèse, ou groupements « grade ». Les groupes paraphylétiques sont souvent des reliques d’hypothèses dépassées de relations phylogéniques d’avant la montée de la cladistique.
ExamplesEdit
les guêpes sont paraphylétiques, composées du clade Apocrita sans fourmis ni abeilles, qui ne sont généralement pas considérées comme des guêpes; les mouches à scie (« Symphyta ») sont également paraphylétiques, car les Apocrita sont imbriquées dans les clades Symphytan.,
les procaryotes (formes de vie unicellulaires sans noyau cellulaire), car ils excluent les eucaryotes, un groupe descendant. Les bactéries et les archées sont des procaryotes, mais les archées et les eucaryotes partagent un ancêtre commun qui n’est pas ancestral aux bactéries. La distinction procaryote/eucaryote a été proposée par Edouard Chatton en 1937 et a été généralement acceptée après avoir été adoptée par Roger Stanier et C. B. van Niel en 1962., Le code botanique (L’ICBN, maintenant L’ICN) a abandonné l’examen de la nomenclature bactérienne en 1975; actuellement, la nomenclature procaryote est réglementée par L’ICNB avec une date de début du 1er janvier 1980 (contrairement à une date de début de 1753 sous L’ICBN/ICN).
parmi les plantes, les dicotylédones (au sens traditionnel) sont paraphylétiques car le groupe exclut les monocotylédones. « Dicotyledon » n’a pas été utilisé comme classification botanique depuis des décennies, mais est autorisé comme synonyme de Magnoliopsida. L’analyse phylogénétique indique que les monocots sont un développement d’un ancêtre dicote., L’exclusion des monocots des dicots fait de ces derniers un groupe paraphylétique.
parmi les animaux, plusieurs groupes familiers ne sont pas, en fait, des clades. L’ordre Artiodactyla (ongulés à doigts pairs) tel qu’il est traditionnellement défini est paraphylétique car il exclut les cétacés (baleines, dauphins, etc.). Dans les rangs du Code ICZN, les deux taxons sont des ordres distincts. Des études moléculaires ont cependant montré que les cétacés descendent d’ancêtres artiodactyles, bien que la phylogénie précise au sein de l’ordre reste incertaine. Sans les cétacés, les artiodactyles sont paraphylétiques.,La classe Reptilia, telle que définie traditionnellement, est paraphylétique car elle exclut les oiseaux (Classe Aves) et les mammifères. Dans les rangs du Code ICZN, ces trois taxons sont des classes distinctes. Cependant, les mammifères proviennent des synapsides (qui étaient autrefois décrits comme des « reptiles ressemblant à des mammifères ») et les oiseaux sont un taxon frère d’un groupe de dinosaures (faisant partie des Diapsida), qui sont tous deux des « reptiles ». Alternativement, les reptiles sont paraphylétiques car ils ont donné naissance à (seulement) des oiseaux. Les oiseaux et les reptiles forment ensemble les Sauropsidés, un clade D’amniotes qui est le groupe frère du clade qui comprend les mammifères.,
Les Ostéichthyes, poissons osseux, sont paraphylétiques lorsqu’ils sont circonscrits pour inclure uniquement les Actinopterygii (poissons à nageoires rayonnées) et les Sarcopterygii (poissons lung, etc.), et d’exclure les tétrapodes; plus récemment, Ostéichtyens est traité comme un clade, y compris les tétrapodes.
Les « guêpes » sont paraphylétiques, composées de L’Apocrita à taille étroite sans les fourmis et les abeilles. Les symphytes (Symphytes) sont également paraphylétiques, formant tous les hyménoptères à l’exception de L’Apocrita, un clade profondément au sein de l’arbre à scies.Les crustacés ne sont pas un clade parce que les Hexapodes (insectes) sont exclus., Le clade moderne qui couvre chacun d’eux est le Tetraconata.
l’Un des objectifs de la taxonomie moderne au cours des cinquante dernières années a été d’éliminer les paraphylétique « groupes » comme les exemples ici depuis des classifications.
Paraphyly in speciesmodifier
Les espèces ont un statut particulier en systématique en tant que caractéristique observable de la nature elle-même et en tant qu’Unité de base de la classification., Certaines articulations du concept d’espèce phylogénétique exigent que les espèces soient monophylétiques, mais les espèces paraphylétiques sont communes dans la nature, dans la mesure où elles n’ont pas un seul ancêtre commun. En effet, pour les taxons reproducteurs sexuellement, aucune espèce n’a d’organisme » unique ancêtre commun ». La paraphylie est courante dans la spéciation, par laquelle une espèce mère (une paraspécifique) donne naissance à une espèce fille sans s’éteindre elle-même. La recherche indique que jusqu’à 20 pour cent de toutes les espèces animales et entre 20 et 50 pour cent des espèces végétales sont paraphylétiques., Compte tenu de ces faits, certains taxonomistes soutiennent que la paraphylie est un trait de la nature qui devrait être reconnu à des niveaux taxonomiques plus élevés.
Les Cladistes préconisent un concept d’espèce phylogénétique qui ne considère pas les espèces comme présentant les propriétés de la monophylie ou de la paraphylie, concepts dans cette perspective qui ne s’appliquent qu’à des groupes d’espèces., Ils considèrent l »extension du sandre de l « argument » espèces paraphylétiques « à des taxons supérieurs pour représenter une erreur de catégorie
utilisations pour les groupes paraphylétiquesmodifier
lorsque l » apparition de traits significatifs a conduit un sous-clade sur une voie évolutive très divergente de celle d « un clade plus inclusif, il est souvent logique d » étudier le groupe paraphylétique qui reste sans considérer le clade plus grand., Par exemple, L’évolution Néogène des artiodactyles (ongulés à bout pair, comme les cerfs, les vaches, les porcs et les hippopotames-notez que les cervidés, les bovidés, les suidés et les hippopotames, les familles qui contiennent ces divers artiodactyles, sont tous des groupes monophylétiques) a eu lieu dans des environnements si différents de ceux des cétacés (baleines, dauphins et marsouins) que les artiodactyles sont souvent étudiés isolément même si les cétacés sont un groupe descendant., Le groupe procaryote en est un autre exemple; il est paraphylétique car il est composé de deux domaines (eubactéries et archées) et exclut (les eucaryotes). Il est très utile car il a une distinction clairement définie et significative (absence de noyau cellulaire, plésiomorphie) de ses descendants exclus.
de plus, certains systématistes reconnaissent que les groupes paraphylétiques sont impliqués dans les transitions évolutives, le développement des premiers tétrapodes à partir de leurs ancêtres par exemple., Tout nom donné à ces ancêtres hypothétiques pour les distinguer des tétrapodes— »poissons », par exemple—choisit nécessairement un groupe paraphylétique, car les tétrapodes descendants ne sont pas inclus. D « autres systématistes considèrent la réification des groupes paraphylétiques pour obscurcir les modèles inférés de l » histoire évolutive.
le terme « grade évolutif » est parfois utilisé pour les groupes paraphylétiques.De plus, les concepts de monophylie, paraphylie et polyphylie ont été utilisés pour déduire des gènes clés pour le codage à barres de divers groupes d’espèces.,
traitements évolués Indépendammentsmodifier
Les hypothèses phylogénétiques actuelles des relations entre tétrapodes impliquent que la viviparité, la production d’une progéniture sans la ponte externe d’un œuf fécondé, s’est développée indépendamment dans les lignées qui ont conduit aux humains (Homo sapiens) et aux scinques d’eau du Sud (eulampus tympanum, une sorte de lézard). En d’autres termes, la viviparité est une synapomorphie pour les Thérias chez les mammifères, et une autapomorphie pour Eulamprus tympanum (ou peut-être une synapomorphie, si d’autres espèces D’Eulamprus sont également vivipares).,
Les »groupes » basés sur des traits développés indépendamment tels que ces exemples de viviparité représentent des exemples de polyphylie, pas de paraphylie.
Non paraphyliemodifier
- Les Poissons amphibies sont polyphylétiques et non paraphylétiques. Bien qu’ils semblent similaires, plusieurs groupes différents de poissons amphibies tels que les sauriens et les lungfishs ont évolué indépendamment dans un processus d’évolution convergente chez des parents éloignés confrontés à des circonstances écologiques similaires.,
- Les oiseaux incapables de voler sont polyphylétiques car ils ont indépendamment (en parallèle) perdu la capacité de voler.
- Les animaux avec une nageoire dorsale ne sont pas paraphylétiques, même si leur dernier ancêtre commun peut avoir eu une telle nageoire, car les ancêtres mésozoïques des marsouins n’avaient pas une telle nageoire, alors que les poissons pré-mésozoïques en avaient une.
- Les archosaures quadrupèdes ne sont pas un groupe paraphylétique. Les dinosaures bipèdes comme Eoraptor, ancestraux aux quadrupèdes, étaient les descendants du dernier ancêtre commun des dinosaures quadrupèdes et d’autres archosaures quadrupèdes comme les crocodiliens.,
liste Non exhaustive des groupes paraphylétiquesmodifier
la liste suivante récapitule un certain nombre de groupes paraphylétiques proposés dans la littérature, et fournit les taxons monophylétiques correspondants.,ia