O piatră de temelie a sănătății publice este prevenirea bolilor. Instrumentele de prevenire a bolilor cu transmitere sexuală, cum ar fi vaccinurile, microbicidele topice și intervențiile comportamentale, reprezintă o parte vitală a protejării publicului împotriva bolilor infecțioase. Gardasil, un vaccin împotriva celor patru tulpini cele mai frecvente de papilomavirus uman (HPV), este o realizare interesantă în domeniul BTS., Cu toate acestea, lucrările de dezvoltare a vaccinurilor sigure și eficiente împotriva altor boli cu transmitere sexuală continuă. Mai ales sunt studiile clinice în curs de desfășurare pentru a evalua un vaccin experimental pentru a preveni herpesul genital.metodele de barieră—cum ar fi prezervativele din latex și microbicidele topice (o substanță aplicată vaginului sau rectului care ucide sau dezactivează microbii care provoacă BTS)—oferă o protecție extrem de eficientă împotriva BTS. Cercetătorii finanțați de NIAID efectuează studii clinice pentru a testa noi microbicide topice și metode de barieră Feminină pentru a preveni bolile cu transmitere sexuală., Utilizate corect și consecvent aceste produse pot reduce foarte mult riscul unei persoane de a dobândi sau de a transmite cele mai multe BTS, inclusiv gonoreea, chlamydia, trichomonas, sifilis, HPV și HIV/SIDA. în plus, cercetătorii susținuți de NIAID efectuează studii intervenționale și comportamentale pentru a identifica condițiile sociale și economice și comportamentele sexuale care pot crește vulnerabilitatea unei persoane la BTS. Rezultatele acestei activități pot reduce disparitățile în materie de sănătate, în special în rândul tinerilor, femeilor și minorităților subreprezentate.