Schirach se objevil často na shromážděních, jako je Norimberský proces z roku 1934, když on se objevil se Hitler ve strhující Hitlerjugend publikum. Akce byla natočena pro triumf vůle, propagandistický film natočený Leni Riefenstahl pro nacistickou stranu. Schirach nastavil militaristický tón mládežnické organizace, která se účastnila cvičení ve vojenském stylu, a praktikovala používání vojenské techniky, jako jsou pušky. V červenci 1939 Schirach Pasově zaplatil formální návštěvu., V červenci 1940, když novou hru Hans Baumann byl představil, Schirach trval na tom, že 2000 místní hitlerjugend členů být součástí tohoto výkonu.
v roce 1940 zorganizoval Schirach evakuaci pěti milionů dětí z měst ohrožených spojeneckým bombardováním. Později téhož roku vstoupil do armády a dobrovolně sloužil ve Francii, kde mu byl udělen Železný kříž, než byl odvolán. Sloužil u 4. (kulometné) roty pěšího pluku Großdeutschland v hodnosti Gefreitera. Během francouzské kampaně byl povýšen na Leutnant a vyznamenán za statečnost.,
Dne 8. srpna 1940, Schirach uspěl Josef Bürckel jako Gauleiter a Reichsstatthalter z Říšská Vídni, výkonný příspěvky, v nichž zůstal až do konce války. Také se mu podařilo Bürckel jako Říšský Komisař Obrany pro Wehrkreis (Vojenský Okres) XVII, které, kromě své vlastní Říšská, včetně Říšská Horním Dunaji, Říšská Dolního Dunaje a část Říšská Sudet. V té době byl nahrazen jako Reichsjugendführer Artur Axmann, ačkoli on udržel jeho pozici jako Reichsleiter pro vzdělávání mládeže. V roce 1941 dosáhl hodnosti SA-Obergruppenführera., Dne 16. listopadu 1942, příslušnosti Obrany Říše Komisařů byl změněn z Wehrkreis na Gau úrovni, a že si ponechala kontrolu civilní obrany opatření pouze Říšská Vídni.
Schirach byl antisemita, zodpovědný za vyslání většiny Židů z Vídně do nacistických koncentračních táborů. Během jeho funkčního období bylo deportováno 65 000 Židů. V projevu dne 15. září 1942 řekl, že jejich deportace je „příspěvkem k evropské kultuře“., V roce 1942, německý skladatel Richard Strauss, přestěhovala se jeho syn František a jeho Židovské dcera-in-law, Alice a jejich děti do Vídně, aby mohli být poskytnuta ochrana Schirach. Při nacistické koncentraci však zemřelo 25 jejích příbuzných camps.In 1944, Alice a Franz byli uneseni vídeňským gestapem a uvězněni na dvě noci. Straussův osobní apel na Schiracha je zachránil, což mu umožnilo vzít je zpět do svého panství v Garmisch-Partenkirchenu, kde zůstali až do konce války v domácím vězení.,
později během války Schirach prosil o mírné zacházení s východoevropskými národy a kritizoval podmínky, za kterých byli Židé deportováni. V roce 1943 upadl v nemilost s Hitlerem, ale zůstal na svém postu ve Vídni.
Schirach byl notoricky znepokojen nálety. Měl sklepích Paláce Hofburg v Vídeň centrum města zrekonstruován a upraven jako protiletecký kryt, a spodní úroveň rozsáhlé podzemní Vídni protivzdušné obrany koordinační centrum v lesích na západ od Vídně se konalo osobní potřeby pro něj., Vídeňané toto velitelské a kontrolní středisko okamžitě nazvali „Schirach-bunkr“.