Nomenklatury a Taxonomie
E. rhusiopathiae, doslova ‚erysipel nit červená nemoc‘, má dlouhou historii s mnoha změny v nomenklatuře. Nejstarší člen rodu Erysipelothrix byl pojmenován E. muriseptica, poprvé izolován Koch v roce 1876 z krve myší s septikémii. Následně byla Erysipelothrix identifikována jako příčina infekce u mnoha druhů zvířat a tří samostatných druhů organismu, e. muriseptica, e. porci a e., erysipeloid, byly navrženy na základě jejich izolace od myší, prasat a lidí. Později bylo zjištěno, že tyto tři organismy byly téměř identické kmeny stejného druhu. Jméno e. insidiosa pro ně navrhl původně Trevisan v roce 1885. Toto a všech 36 dalších zdokumentovaných názvů organismu bylo v roce 1966 odmítnuto ve prospěch e. rhusiopathiae, kombinace, která vznikla v roce 1918 .
Erysipelothrix prokázal velkou sérologickou, biochemickou a antigenní variabilitu mezi kmeny., Testování patogenity ukázalo, že shluk avirulentních kmenů sérotypu 7 pocházel převážně z prasečích mandlí . Později bylo zjištěno, že jsou geneticky odlišné od E. rhusiopathiae složením dna báze a homologickými studiemi DNA-DNA . Tyto kmeny tvořily základ nového druhu, e. tonsillarum, a patřil k sérotypům 3, 7, 10, 14, 20, 22 a 23. Některé další kmeny představující sérotyp 13 (Erysipelothrix sp . kmen 1) a 18 (Erysipelothrix sp. kmen 2) vykazoval nízké úrovně hybridizace s typovými kmeny jak e. rhusiopathiae, tak e., tonsillarum, což naznačuje, že tyto sérotypy mohou být členy nového genomického druhu . Původně byl E. tonsillarum považován za morfologicky a biochemicky identický s e. rhusiopathiae, ale později bylo prokázáno, že e .tonsillarum může kvasit sacharózu, zatímco e. rhusiopathiae nemohl. Kromě toho byla většina kmenů E .tonsillarum (96%) avirulentní, zatímco 66% kmenů E. rhusiopathiae produkovalo onemocnění prasat. Na druhé straně studie zjistila, že e. tonsillarum byl izolován ze systémových míst z 3, 4% jatečně upravených těl, která byla negativní pro e., rhusiopathiae, což naznačuje potenciální význam tohoto organismu v patogenezi prasečí erysipelas . Srovnání proteinové složení pomocí počítačové metodě vyhodnocení bylo zjištěno, že geometrický průměr podobnosti byl 0.980±0.018 mezi E. rhusiopathiae kmenů, 0.979±0.013 pro E. tonsillarum kmenů a 0.932±0.036 mezi kmeny jiných Erysipelothrix druhů. Studie však nestanovila prahovou hodnotu použitelnou pro identifikaci daného kmene na druhovou úroveň . Fylogenetická analýza genů 16S rRNA e. rhusiopathiae A E., tonsillarum ukázal, že obě sekvence jsou téměř totožné (99.8%), pouze tři nukleotidové rozdíly . I když to bylo navrhl, že 16S rRNA sekvence mohou být použity běžně rozlišit a stanovit vztahy mezi rody a dobře vyřešen druhů, v poslední době velmi lišily druhy, jako E. rhusiopathiae a E. tonsillarum nemusí být odlišitelné .
E. rhusiopathiae je pravděpodobné, že být zaměněny s jinými Gram-pozitivní, non-sporing, tyčinkovité bakterie, jako jsou členové rodů Brochothrix, Corynebacterium, Lactobacillus, Listeria a Kurthia., To bylo kdysi považováno za blízkého příbuzného rodu Listeria, ale studie buněčné stěny peptidoglykanu , mastné kyseliny vzorce , hybridizace DNA , a numerické taxonomické studie nepodpořila tento vztah. Erysipelothrix lze odlišit od listerie ve složení buněčné stěny, protože Erysipelothrix obsahuje lysin a glycin, zatímco Listeria obsahuje kyselinu mesodiaminopimelovou . Žádné společné antigeny, mezi kmeny Erysipelothrix a Listeria monocytogenes byly detekovány immunodiffusion nebo pasivní hemaglutinace testy . Brochothrix a Corynebacterium byly také odlišeny od E., rhusiopathiae na bázi obsahující kyselinu mesodiaminopimelovou v buněčné stěně. Katalázový test může rozlišit e. rhusiopathiae od katalázově pozitivních druhů Kurthia. Bližší vztah Erysipelothrixu k rodině Lactobacillaceae než k Corynebacteriaceae byl odhalen pomocí studií poměru enzymů a DNA. Ve studii více než 200 kmenů bakterií coryneform pomocí morfologických, fyziologických a biochemických testů a počítačové analýzy byla Erysipelothrix nejblíže příbuzná Streptococcus pyogenes ., Další molekulární taxonomické studie dospěly k závěru, že rod Erysipelothrix je zřetelná skupina organismů, nejvíce podobná streptokokům .
výsledky analýzy rRNA 16S ukázaly, že e .rhusiopathiae má bližší vztah k Clostridium innocuum. Oba organismy obsahují lysin ve své buněčné stěně. C. innocuum je členem RNA clusteru, který obsahuje mykoplazmata a který sám je součástí mnohem širší skupiny klostridií ., Fylogenetické analýzy založené na Hsp70 sekvence v dnaK (hsp70) genové oblasti Mycoplasma capricolum ukázal, že Mycoplasma druhů rozvětvené s nízkými G+C obsah Gram-pozitivní skupiny bakterií, včetně bakterií Lactobacillus a Erysipelothrix druhů v 87% a 96% bootstrap opakování, respektive, což naznačuje blízký evoluční vztah Erysipelothrix do této skupiny .
Nejnovější Kompletní analýza genomové sekvence ukazuje, že celkové vlastnosti genomu e. rhusiopathiae jsou podobné jako u jiných Gram-pozitivních bakterií., Nicméně, to postrádá mnoho ortologní geny pro biosyntézu stěny teichoové kyseliny (WTA) a lipoteichoové kyseliny (LTA) a dltABCD operon. Má úplnou ztrátu biosyntézy mastných kyselin a postrádá geny pro biosyntézu mnoha aminokyselin, kofaktorů a vitamínů. Ty naznačují reduktivní evoluci genomu. E. rhusiopathiae genomu představuje evoluční rysy obou Firmicutes a Mollicutes a poskytuje nové poznatky do své evoluční adaptace pro intracelulární přežití .