König von England
William war bereits ein erfahrener Herrscher. In der Normandie hatte er illoyale Adlige und herzogliche Diener durch seine Freunde ersetzt, private Kriegsführung eingeschränkt und usurpierte herzogliche Rechte wiederhergestellt, um die Pflichten seiner Vasallen zu definieren. Die normannische Kirche blühte unter seiner Herrschaft auf, als er ihre Strukturen an englische Traditionen anpasste. Wie viele zeitgenössische Herrscher wollte er, dass die Kirche in England frei von Korruption ist, ihm aber auch untergeordnet ist. So verurteilte er Simony und missbilligte die klerikale Ehe., Er duldete keinen Widerstand der Bischöfe oder Äbte oder eine Einmischung des Papsttums, aber er blieb mit den Päpsten Alexander II. und Gregor VII. in guten Beziehungen—obwohl gelegentlich Spannungen auftraten. Während seiner Regierungszeit wurden Kirchensynoden viel häufiger abgehalten und er leitete auch mehrere Bischofsräte. Er wurde dabei von seinem engen Berater Lanfranc geschickt unterstützt, den er Erzbischof von Canterbury machte und Stigand ersetzte; William ersetzte alle anderen angelsächsischen Bischöfe Englands-außer Wulfstan von Dorchester—durch Normannen., Er förderte auch die Klosterreform, indem er normannische Mönche und Äbte importierte, wodurch das Tempo des Klosterlebens in England beschleunigt und mit den kontinentalen Entwicklungen in Einklang gebracht wurde.
William verließ England Anfang 1067, musste aber im Dezember zurückkehren, um mit Unruhen fertig zu werden. Die Rebellionen, die in diesem Jahr begannen, erreichten ihren Höhepunkt im Jahr 1069, als William auf so gewalttätige Maßnahmen zurückgriff, dass sogar Zeitgenossen schockiert waren. Um seinen Einfluss auf das Land zu sichern, führte er die normannische Praxis des Burgenbaus ein, einschließlich des Tower of London., Die Rebellionen, die von 1071 niedergeschlagen wurden, vervollständigten den Ruin der englischen höheren Aristokratie und sicherten ihren Ersatz durch eine Aristokratie normannischer Herren, die in der Normandie entwickelte Muster der Landbesitznahme und des Militärdienstes einführte. Um Englands Grenzen zu sichern, fiel er 1072 in Schottland und 1081 in Wales ein und schuf spezielle defensive „Marcher“ – Grafschaften entlang der schottischen und walisischen Grenzen.
In den letzten 15 Jahren seines Lebens war William häufiger in der Normandie als in England, und es gab fünf Jahre, möglicherweise sieben, in denen er das Königreich überhaupt nicht besuchte. Er behielt die meisten der größten anglo-normannischen Barone bei sich in der Normandie und vertraute die Regierung Englands Bischöfen an, besonders seinem alten Freund Lanfranc vertrauend., Er kehrte erst nach England zurück, als es unbedingt notwendig war: 1075, um die Folgen eines Aufstands von Roger, Earl of Hereford, und Ralf, Earl of Norfolk, zu bewältigen, der durch das Eingreifen einer dänischen Flotte gefährlicher wurde; und 1082, um seinen Halbbruder Odo zu verhaften und einzusperren, der vorhatte, eine Armee nach Italien zu bringen, vielleicht um sich zum Papst zu machen. Im Frühjahr 1082 ließ William seinen Sohn Henry zum Ritter schlagen, und im August nahm er in Salisbury von allen wichtigen Grundbesitzern in England Treueeide ab., Im Jahr 1085 kehrte er mit einer großen Armee zurück, um der Bedrohung durch eine Invasion von Canute IV (Canute der Heilige) Dänemarks zu begegnen. Als dies aufgrund von Canutes Tod im Jahr 1086 zu nichts kam, befahl William, eine wirtschaftliche und tenuriale Umfrage über das Königreich durchzuführen, deren Ergebnisse in den beiden Bänden des Domesday Book zusammengefasst sind, eine der größten administrativen Errungenschaften des Mittelalters.
Trotz seiner Pflichten als König Wilhelm blieb damit beschäftigt, die Grenzen der Normandie auch noch nach der Eroberung. Die Gefahrenstellen waren in Maine und der Vexin an der Seine, wo die Normandie an die französische königliche Demesne grenzte. Nach 1066 wurden Wilhelms kontinentale Nachbarn mächtiger und noch feindlicher. Fulk der Surly folgte Anjou 1068 und Robert der Friese 1071 nach Flandern., König Philipp I. von Frankreich verbündete sich mit Robert und Robert verbündete sich mit dem dänischen König Canute IV. Es gab auch das Problem von Wilhelms Erben Robert Curthose (dem zukünftigen Robert II), der, da er kein Waisenhaus hatte (Gewährung von Land aus der königlichen Domäne) und scheinbar wenig Geld hatte, 1077 die Normandie verließ und mit den Feinden seines Vaters faszinierte. Im Jahr 1081 einigte sich William mit Fulk im Vertrag von Blancheland: Robert Curthose sollte Graf von Maine sein, aber nur als Vasall von Fulk., Der östliche Teil der Vexin, die Grafschaft Mantes, war 1077 vollständig in König Philipps Hände gefallen, als William mit Maine beschäftigt gewesen war. Im Jahr 1087 forderte William von Philipp die Rückkehr der Städte Chaumont, Mantes und Pontoise. Im Juli trat er überraschend in Mantes ein, aber während die Stadt brannte, erlitt er entweder eine Verletzung, von der er sich nie erholte, oder er wurde tödlich krank (Quellen unterscheiden sich). Er wurde in dem Moment vereitelt, als er im Begriff zu sein schien, seinen letzten noch ausstehenden Gebietsanspruch durchzusetzen.