1988. augusztus 26-án Aung San Suu Kyi nemzeti elismerést szerzett az ellenzéki Nemzeti demokrácia Liga (NLD) hatékony vezetőjeként, később a katonai vezetésű SLORC ellen. Aung San Suu Kyi lett a Nemzeti Liga a demokráciáért főtitkára, karizmatikus és hatékony szónok volt a demokrácia mellett az egész országban. A SLORC házi őrizetbe helyezte, mert megpróbálta megosztani a hadsereget, ezt a vádat következetesen tagadta.,
bár 1990.május 27-én nem indulhatott a választásokon, pártja, az NLD a hadsereg megdöbbenésére és bosszankodására a törvényhozási helyek 80 százalékát nyerte el. Soha nem engedték meg nekik, hogy hivatalba lépjenek. Házi őrizetének első éveiben Aung San Suu Kyi nem volt látogatható, de később közvetlen családja megengedte, hogy vele legyen alkalmi utazások Mianmarba. 1994 januárjában az első látogató a családján kívül, Bill Richardson amerikai kongresszusi képviselő, egy új-mexikói Demokrata, találkozhatott vele., Lelkiismereti fogolyként ismerte el az Amnesty International. Az ENSZ és számos más nemzeti és nemzetközi csoport kérte feltétel nélküli szabadon bocsátását. Számos díjat nyert a demokráciáért és az Emberi Jogokért, köztük a Szaharov-díjat a gondolatszabadságért (Európai Parlament, 1991), a Nobel-békedíjat (1991) és a nemzetközi Simon Bolivar-díjat (UNESCO, 1992).
Aung San Suu Kyi 1995 júliusáig katonai felügyelet alatt és házi őrizetben maradt., A kormány folyamatosan korlátozta mozgását mind az országban, mind külföldön. Suu Kyi első szabad éve alatt, csak rövid utazást engedélyezett szülővárosában, Rangoonban és környékén, és nem utazott Mianmaron kívül. Folytatta azonban, hogy az NLD vokális vezetőjeként szolgáljon, és szorgalmazza a demokráciát.