Corpuscular Filosofi
Den Skeptiske Chymist (1661), selv om en av Boyle»s mer teoretiske arbeider og lidelse fra sin vanlige mangel på organisasjon, godt illustrerer hans påstand er at alle vitenskapelig undersøkelse må være solid forankret i eksperimentet., Regissere sitt angrep på det han oppfattet som den feilaktige grunnlaget for moderne kjemisk teori, han tok fram omfattende eksperimentelle bevis for å tilbakevise den rådende Aristoteliske og Paracelsian konsepter av et lite antall av grunnleggende elementer eller prinsipper som alle forbindelser kan reduseres ved kjemisk analyse. Han viste at vanlige kjemiske stoffer når dekomponert av varme, ikke bare unnlatt å gi det nødvendige antall elementer eller prinsipper, men at antallet var en funksjon av teknikker ansatt., Derfor nektet han at elementer eller prinsipper (som dermed definert) hadde noen reell eksistens, og søkte å erstatte disse eldre begrepene kjemisk endring med hva han kalte «corpuscular filosofi.»
Selv om han understreket nødvendigheten av å basere forskningen på eksperiment, Boyle var ikke en enkel empiricist. Bak hans mer spesifikk og detaljert arbeid var en generell teori om strukturen av saken, og hans fortsatte støtte til den mekaniske filosofi—som er, forklaring i form av materie og bevegelse—var en av hans mest betydelige bidrag., I henhold til Boyle»s corpuscular filosofi, Gud hadde opprinnelig dannet saken i ørsmå partikler av varierende størrelser og former. Disse partiklene hadde en tendens til å kombinere i grupper eller klynger som, på grunn av sin kompakthet, hadde en rimelig kontinuerlig eksistens, og var de grunnleggende enheter av kjemiske og fysiske prosesser. Enhver endring i form, størrelse, eller bevegelse av disse grunnleggende klynger endret egenskapene til stoffet som er involvert, selv om kjemiske reaksjoner generelt ble oppfattet som involverer først og fremst foreningen og dissosiasjon av ulike klynger.,
Boyle har også gjort betydelige bidrag til eksperimentell kjemi. Han har gjort omfattende studier av calcination av metaller, av forbrenning, og av egenskaper av syrer og baser. Han la vekt på anvendelse av fysiske teknikker til kjemiske undersøkelser og utviklet for bruk av kjemiske indikatorer som viste karakteristiske farge endringer i nærvær av visse typer stoffer. Hans banebrytende studier av fosfor, hvor han oppdaget at nesten alle egenskaper som er kjent for de neste to århundrene, godt illustrerer effektiviteten av hans eksperimentelle teknikker.